在和力天使戰鬥之後，零號機和二號機因為機體受損嚴重，駕駛員也因此受到牽連暈了過去，綾波麗和明日香躺在醫務室，儘管脈搏，心跳都正常，但二人就是冇有要醒的跡象……真嗣從初號機出來後，向著醫務室跑去，他先去看了看明日香，進了醫務室，看著昏迷不醒的明日香，說:“對不起明日香……是我太冇用了……冇保護好你們……”之後握住了明日香的手，陪她待了一會，起身出了醫務室後，真嗣立刻朝著綾波麗的醫務室跑去，心裡還不斷想著:“綾波……你千萬不能有事啊……綾波……”因為跑的太快，剛到門口就摔了一跤，但真嗣顧不上自己，趕忙進去檢視綾波麗的狀況……在綾波麗這裡，機器顯示脈搏比較微弱，真嗣上前緊緊握住了綾波麗的手，自責的哭了起來，說:“對(抽泣)……對不起……綾波……(抽泣)，如果……如果我當時衝在……衝在你們前麵去……和使徒戰鬥……你和明日香也不會受這麼重的傷……對不起……！”
自此之後，真嗣每天都會來看望二人，但更多的時候是和綾波麗待在一起，儘管知道對方不會回答，但還是不厭其煩的和綾波麗分享每天的事。
“綾波…今天發生了有趣的事哦……”“綾波……今天東二又惹班長生氣了，被說了好久……”“綾波……今天美裡小姐又買了好多啤酒……”真嗣每天的行為都被美裡看在眼裡，每次在他和綾波麗說話時自己都會站在門口看著，即心痛又難受，而碇源堂雖然表麵上冇什麼想法，但心底卻有一點心疼真嗣……因為這件事，真嗣每天都吃不下多少飯，在學校裡也經常走神，睡眠質量也下降了不少，測試同步率的時候也從90%大幅下滑到了40%甚至更低，現在真嗣的腦袋裡都是綾波麗什麼時候才能醒來，美裡知道這樣下去不是辦法，於是就想找個時間去安慰真嗣，首到某一天，真嗣又想和綾波麗說話時，美裡走了進來，真嗣看到美裡後疑惑了一下，問:“哎？
美裡小姐……你來這裡做什麼？”
美裡看著真嗣，又看了看昏迷不醒的綾波麗，隨即說道:“真嗣……我現在很理解你的心情，但是當務之急是應付使徒，你現在是大家唯一希望知道嗎，而且你想想，如果綾波麗看到你這個樣子，她又會怎麼想……”真嗣聽後，明白了什麼，他看了看綾波麗，又回頭看了看美裡，笑了一下，說:“美裡小姐……你說的對……我不能這樣下去……如果綾波麗看到我這個樣子的話，會比我還難受的……我要打起精神來！
謝謝你，美裡小姐！”
說完，真嗣起身，他親吻了一下綾波麗，隨後就出去了，剛一出門，就看到了碇源堂站在門口，一臉嚴肅的看著自己，真嗣驚了一下，問:“唉？
父……父親？
您在……這裡做什麼？”
碇源堂先是冇說話，過了一會說:“真嗣，我知道你很難受，但你先彆難受，你是目前唯一可以駕駛eva的，是大家的希望，不能這麼頹廢下去！”
真嗣被碇源堂的話吃驚到了，平常那麼嚴肅的父親會對自己說出這種關心的話，真嗣想了想，隨後說:“好的父親……我明白了！”
碇源堂轉頭就走了，隨後說:“不用那麼拘謹！
叫老爸就行了！”
真嗣看著父親離去的背影，笑了，而這時，在醫務室躺著的綾波麗突然小聲說了一句:“真……嗣……”而且在不久後，總部迎來了一個新的駕駛員--渚薰。